海洋研究所は設立の1962年4月から1992年3月までの歴史を『東京大学海洋研究所30年史』に記している.気候システム研究センターは1991 年4 月に発足した.大気海洋研究所は2010 年4 月に両組織の統合により発足した.本章では最近20 年間の歴史を述べる.