本所の教員は上記の各専攻に関連する本学学部の教育にも携わっており，2012年3月現在，理学部地球惑星物理学科・地球惑星環境学科・化学科・生物学科，農学部水圏生命科学専修・水圏生産環境科学専修，工学部社会基盤学科の3，4年生の講義を担当している．また，本学教養学部1，2年の学生を対象とした「全学自由研究ゼミナール」および「全学体験ゼミナール」を所の教員が協力して担当し，大気海洋科学の広い分野の研究成果をわかりやすく学部学生に伝えている．
本所は全国の学部学生を対象に，大気海洋研究にふれて将来の進路を決める際の参考にしてもらうために，「大気海洋科学インターンシップ」を海洋研究所時代の2009年から実施している．春休み周辺の期間に3日程度柏キャンパスあるいは大槌キャンパスに通ってもらい，通常の一般公開あるいは進学ガイダンスでは体験できない最先端の研究を実際に体験することにより，研究所で学ぶ魅力を知ってもらっている．
